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在當今生命科學研究領(lǐng)域,多組學分析正發(fā)揮著越來越重要的作用。通過整合基因組學、轉(zhuǎn)錄組學、蛋白質(zhì)組學、代謝組學等多種組學技術(shù),這種綜合分析方法可以幫助我們更好地理解生命現(xiàn)象的復雜性和動態(tài)性。今天,就讓我們通過實例,深入了解多組學分析的神奇之處。
多組學分析
發(fā)現(xiàn)不同組學數(shù)據(jù)之間的關(guān)聯(lián)
多組學分析的優(yōu)勢不僅在于它能夠提供更全面的信息,還在于它可以幫助我們發(fā)現(xiàn)不同組學數(shù)據(jù)之間的關(guān)聯(lián)。
例如,通過整合轉(zhuǎn)錄組學和蛋白組學數(shù)據(jù),我們可以發(fā)現(xiàn)基因表達和蛋白表達之間的關(guān)系;通過結(jié)合代謝組學和蛋白組學數(shù)據(jù),我們可以了解代謝物和蛋白質(zhì)之間的相互作用。這些關(guān)聯(lián)可以為我們提供更深入的生物學理解,并為疾病診斷、藥物研發(fā)和農(nóng)業(yè)生產(chǎn)等領(lǐng)域提供新的思路和方法。
例如,在心血管疾病研究中,多組學分析可以幫助我們發(fā)現(xiàn)新的因果因子。一項研究通過整合基因組學和轉(zhuǎn)錄組學數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)了一些與冠狀動脈疾病相關(guān)的基因和轉(zhuǎn)錄本。這些基因和轉(zhuǎn)錄本的表達變化可能與疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),為開發(fā)新的診斷和治療方法提供了潛在的靶點。
近年來,有課題研究組在《Environmental Health Perspectives》期刊上發(fā)表的研究文章指出,借助多組學聯(lián)用技術(shù),發(fā)現(xiàn)多氯聯(lián)苯的醌類代謝物暴露會引發(fā)內(nèi)皮損傷,進而推動心血管疾病的進程。組學測序結(jié)果表明,非編碼 RNA HDAC7-AS1 與 MIR-7-5p 通過 Ago2 實現(xiàn)特異性結(jié)合,HDAC7-AS1 作為內(nèi)源性 RNA 與 TGF-β2 競爭性地結(jié)合 MIR-7-5p,并且臨床樣本證實,冠狀動脈粥樣硬化性心臟病患者血漿中這三者的水平呈正相關(guān)。該研究提示,血漿中的非編碼 RNA 可作為多氯聯(lián)苯暴露相關(guān)的動脈粥樣硬化的診斷生物標志物和治療靶點。疾病的發(fā)生發(fā)展是一個極為復雜的過程,單一組學數(shù)據(jù)分析往往難以闡明其中復雜的因果關(guān)系。而多組學整合分析則能夠?qū)⒉煌瑢用娴臄?shù)據(jù)之間的相互作用與調(diào)控關(guān)系進行整合,這對于系統(tǒng)地了解疾病進展的多維變化具有重要意義。
2022年《Signal Transduction and Targeted Therapy》上一篇矽肺機制研究的文章,利用二氧化硅暴露的小鼠模型并在二氧化硅暴露后的不同時間點(2W、4W、6W、10W)收集小鼠的肺組織進行蛋白組、磷酸組、轉(zhuǎn)錄組處理,構(gòu)建了多組學圖譜來描述矽肺的關(guān)鍵異常并開發(fā)靶向藥物。對三組數(shù)據(jù)進行聯(lián)合分析,結(jié)合研究目標進行結(jié)果驗證。總共鑒定到鑒定了22,046個轉(zhuǎn)錄本、11,836個蛋白質(zhì)和16,399個磷酸位點,樣品能夠明顯被區(qū)分開。通過整合三個組學的數(shù)據(jù),對矽肺進展中的多組學變化動態(tài)景觀進行分析,從不同層面更好地解析了矽肺的病理機制,并為開發(fā)新的治療策略提供依據(jù)。
總之,多組學分析是一種強大的研究工具,為我們提供了更全面、系統(tǒng)的視角來理解生命現(xiàn)象。通過實例解析,我們可以看到多組學分析在各研究方面的廣泛應用和巨大潛力。相信在未來,多組學分析將繼續(xù)為科學研究和人類健康做出更大的貢獻。
斯坦德生命科學致力于為客戶提供一站式的多組學檢測服務。我們擁有專業(yè)的技術(shù)團隊、先進的檢測設(shè)備和完善的數(shù)據(jù)分析平臺,能夠為客戶提供高質(zhì)量、高效率的多組學檢測解決方案。我們相信,多組學檢測將不斷助力科學研究帶來新的突破,為生命科學研究的發(fā)展做出貢獻。
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